В организме одного человека одновременно могут присутствовать разные варианты SARS-CoV-2, которые прячутся в разных органах - например, в селезенке или в почках. Парадоксально, но благодаря этому открытию ученые нашли способ, который может способствовать эффективной ликвидации коронавируса.
По мере развития пандемии появляется все больше вариантов SARS-CoV-2, которые вытеснили его первоначальную форму, что очень затрудняет борьбу с ним с помощью вакцинации или терапии антителами.
«Постоянное появление новых вариантов привело к полной замене исходного вируса, и в настоящее время доминируют варианты Omikron и Omikron 2», - подчеркивает проф. Имре Бергер из Бристольского университета, автор нового исследования, опубликованного в журнале Nature Communications. В публикации исследователи указали на еще одну проблему: вирус также может по-разному развиваться в клетках одного и того же хозяина. К такому выводу они пришли, проанализировав ранний вариант, обнаруженный в Бристоле - BrisDelta..
Этот вариант представляет собой небольшую субпопуляцию SARS-CoV-2, но, по-видимому, он гораздо легче атакует некоторые клетки, чем исходный вирус.
„Наши результаты показывают, что у одного человека может быть несколько вариантов вируса в организме. Некоторые из них могут использовать клетки почек или селезенки, чтобы спрятаться в них, пока организм занят борьбой с доминирующим вариантом. Это может затруднить избавление инфицированного пациента от SARS-CoV-2», - объясняет доктор Капил Гупта, один из исследователей, участвующих в этом проекте.
Исследователи, используя синтетические аналоги вируса, а также визуализацию и компьютерные методы, показали, что изменение формы шиповидного белка позволяет вирусу скрываться от иммунной системы. Однако в каждом из них есть особая структура - карман, который, по мнению ученых, имеет решающее значение для степени контагиозности возбудителя.
„Избегая прикрепления вызывающих воспаление жирных кислот, вирус становится менее заметным для иммунной системы. Это может быть механизм уклонения от обнаружения хозяина и сильного иммунного ответа в течение более длительного периода времени и повышения эффективности инфекции», - говорит ведущий автор исследования, доктор Оскар Штауфер из Центра Макса Планка в Бристоле.
«Похоже, что карман, специально сформированный для распознавания этих жирных кислот, дает SARS-CoV-2 преимущество в заражении людей и позволяет вирусу быстро размножаться. Это может объяснить, почему он присутствует во всех вариантах, включая Омикрон», - добавляет проф. Бергер.
Но есть и хорошая новость: карман остается прежним вне зависимости от мутации вируса. «Интересно, что эта же черта дает нам уникальную возможность победить вирус именно потому, что она строго поддерживается. Таким образом, вы можете создать совпадающую с вирусом частицу, которая будет нацелена на этот карман», - поясняет эксперт. Halo Therapeutics, дочерняя компания Бристольского университета, уже работает над препаратами этого типа.