Как изучать основы биохимии (с иллюстрациями)

Биохимия объединяет изучение биологии с изучением химии для изучения метаболических путей на клеточном уровне в организмах. Помимо применения в изучении метаболических путей у растений и микроорганизмов, биохимия - это экспериментальная наука, которая в значительной степени зависит от наличия специального оборудования, уникального для этой дисциплины. Это обширная тема, но есть некоторые базовые концепции, которые будут рассмотрены в любом начальном курсе биохимии.

Шаги

Часть 1 из 3: Определение основ

Шаг 1. Запомните структуру аминокислот

Аминокислоты являются строительными блоками всех белков. Запоминание структуры и свойств всех 20 аминокислот - важный аспект биохимии. Знайте их одно- и трехбуквенные сокращения, чтобы быстро узнавать их во время учебы. Создание карточек - отличный способ запомнить структуру аминокислот.

Выучите аминокислоты в 5 группах по 4 штуки.
Запомните основные свойства, такие как кислотные (отрицательно заряженные) по сравнению с основными (положительно заряженные) и полярные по сравнению с гидрофобными.
Рисуйте их структуры снова и снова, пока не запомните их. К счастью, аминокислоты имеют похожую структуру. Каждая из них содержит основную аминогруппу (-NH2), кислотную карбоксильную группу (-COOH) и водородную группу (-H). Они отличаются органической группой R (или боковой цепью), которая определяет их функцию и уникальна для каждой аминокислоты.

Шаг 2. Распознайте белковые структуры

Белки состоят из цепочек аминокислот. Распознавание различных уровней белковых структур и умение рисовать наиболее важные из них (альфа-спирали и бета-листы) - фундаментальные концепции биохимии. Существует четыре уровня белковой структуры:

Первичная структура - это линейное расположение аминокислот. Они удерживаются вместе пептидными связями в полипептидной цепи.
Вторичная структура состоит из участков белков, которые складываются в альфа-спирали и бета-листы, которые управляются водородными связями.
Третичная структура - это трехмерная структура, возникающая в результате взаимодействий между аминокислотами, обычно за счет дисульфидных связей, водородных связей и гидрофобных взаимодействий. Это физиологическая форма белка. Третичная структура многих белков до сих пор неизвестна.
Четвертичная структура возникает в результате взаимодействия нескольких отдельных белков с образованием одного большего единого белка. Они часто содержат субъединицы и имеют шаровидную форму.

Шаг 3. Изучите шкалу pH

PH раствора является мерой кислотности. Это связано с количеством водорода и гидроксид-ионов, присутствующих в растворе. Кислый раствор содержит больше ионов водорода и меньше гидроксид-ионов. Обратное верно для основных растворов: больше гидроксид-ионов, меньше ионов водорода.

Кислоты ионно-водородные (H⁺) доноры и имеют pH <7.
Основания - ион водорода (H⁺) акцепторы и имеют pH> 7.

Шаг 4. Определите pK_а решения.

K_а раствора используется для прогнозирования степени диссоциации кислоты или того, насколько легко кислота отдает свои ионы водорода. Он определяется уравнением K_а = [H⁺] [A^-] / [HA]. K_а большинство решений можно найти в таблице в учебнике или в Интернете. ПК_а определяется как отрицательный логарифм K_а.

Сильные кислоты полностью диссоциируют и имеют очень маленький pK_ас. Слабые кислоты не полностью диссоциируют и имеют более высокий pK_ас.

Шаг 5. Соотнесите pH и pK._а используя уравнение Хендерсона-Хассельбаха.

Уравнение Хендерсона-Хассельбаха используется для приготовления буферов для растворов в лаборатории. Он также используется в кислотно-основных реакциях для определения равновесного pH. Уравнение утверждает, что pH = pK_а + журнал [основание] / [кислота]. ПК_а раствора равно pH раствора, когда концентрации кислоты и основания одинаковы.

Буфер - это раствор, который сопротивляется изменению pH при добавлении к нему небольших количеств кислых или основных растворов. Они важны для поддержания стабильного pH раствора. Буферы также важны в биологических системах, таких как поддержание pH человеческого тела на уровне 7,4

Шаг 6. Распознайте ионные и ковалентные связи

Ионная связь образуется между атомами, когда один или несколько электронов удаляются от одного атома и передаются другому атому. Затем образующиеся положительно и отрицательно заряженные ионы притягиваются друг к другу. Ковалентные связи образуются, когда два атома разделяют пары электронов.

Другие силы, такие как водородные связи (силы притяжения между атомами водорода и высоко электроотрицательными молекулами), также важны.
Тип связи, образующейся между атомами, определяет некоторые свойства, которыми будет обладать молекула.

Шаг 7. Узнайте о ферментах

Ферменты - важный класс белков в организме, которые используются для катализирования (увеличения скорости) биохимических реакций за счет снижения энергии активации. Почти каждая биохимическая реакция в организме катализируется определенным типом фермента; поэтому изучение механизма ферментативной функции является важным предметом биохимии. Исследуется в основном с кинетической точки зрения.

Ингибирование ферментов используется фармакологически для лечения многих заболеваний, поражающих организм.
Ферменты не изменяются и не расходуются в реакциях, поэтому они могут выполнять множество циклов катализа.

Часть 2 из 3: Запоминание метаболических путей

Шаг 1. Прочтите и изучите рисунки пути

При изучении биохимии вам необходимо запомнить ряд важных метаболических путей: гликолиз, окислительное фосфорилирование, цикл лимонной кислоты (цикл Кребса), цепь переноса электронов и фотосинтез, и это лишь некоторые из них.

Прочтите соответствующий текст в своей книге и изучите рисунок, подробно описывающий процесс пути.
Вероятно, вам нужно будет уметь нарисовать весь цикл на тесте.

Шаг 2. Изучите один путь за раз

Если вы попытаетесь изучить все пути сразу, вы запутаете их и не получите прочной основы ни для одного из них. Сосредоточьтесь на изучении одного пути и просмотрите его в течение нескольких дней, прежде чем переходить к следующему.

Как только вы выучите одну из них, не позволяйте ей исчезнуть. Чаще перерисовывайте его, чтобы не забыть о нем.
Пройдите онлайн-викторины или попросите друга расспросить вас, чтобы метаболические пути оставались свежими в вашей памяти.

Шаг 3. Нарисуйте основной путь

Когда вы только начинаете учиться, начните с основного пути. Некоторые пути представляют собой цикл, который продолжается (цикл лимонной кислоты), в то время как другие пути представляют собой линейный процесс (гликолиз). Начните обучение с запоминания формы пути, того, где он начинается, что разрушается и что синтезируется.

Для каждого цикла у вас будут исходные молекулы, такие как НАДН, АДФ или глюкоза, и конечные продукты, такие как АТФ и гликоген. Сначала запомните эти общие части

Шаг 4. Добавьте кофакторы и метаболиты

А теперь уточните путь. Метаболиты - это промежуточные молекулы, которые образуются в процессе, но затем расходуются по мере продолжения реакции. Есть также кофакторы, которые необходимы или помогают увеличить скорость реакции.

Избегайте запоминания ради запоминания. Узнайте, как каждое промежуточное звено превращается в следующее, чтобы у вас было реальное понимание процесса, а не просто заучивание наизусть

Шаг 5. Наберите необходимые ферменты

Последний шаг к запоминанию пути - добавление ферментов, необходимых для проведения реакции. Изучение пути по частям сделает его менее утомительным для начала. Как только вы выучите все названия ферментов, весь путь будет завершен.

Теперь вы сможете легко записать каждый белок, метаболит и молекулу, участвующую в метаболическом пути.
Убедитесь, что вы знаете, какие этапы пути необратимы и почему (если применимо).

Шаг 6. Часто просматривайте пути

Информацию такого типа необходимо просматривать и перерисовывать еженедельно, иначе вы ее забудете. Каждый день уделяйте время тому, чтобы пересматривать разные пути, и убедитесь, что вы знаете, где они проходят. К концу недели вы изучите их все, а затем сможете приступить к работе на следующей неделе.

Когда настанет время теста, вам не придется беспокоиться об изучении всех метаболических путей, потому что вы их уже запомните

Часть 3 из 3: Изучение основ

Шаг 1. Прочтите учебник

Чтение учебника для любого курса, который вы изучаете, имеет важное значение для изучения предмета. Перед занятием прочтите и просмотрите материал, который будет рассмотрен в этот день. Делайте заметки о том, что вы читаете, и вы будете лучше подготовлены к уроку.

Обязательно прочтите для понимания. В конце каждого раздела резюмируйте материал в своих заметках.
Попробуйте ответить на некоторые вопросы в конце главы, чтобы проверить свое понимание концепций.

Шаг 2. Изучите рисунки из учебника

Рисунки в вашем учебнике очень подробны и помогают наглядно представить, о чем вам говорится в тексте. Часто гораздо легче понять концепцию, глядя на ее картинку, чем просто читая слова.

Нарисуйте важные цифры в своих заметках, чтобы вернуться к ним и изучить их позже

Шаг 3. Раскрасьте свои заметки цветом

В биохимии много сложных процессов. Разработайте и используйте систему цветового кодирования для своих заметок. Может быть, напишите заметки, исходя из сложности, с одним цветом, представляющим действительно сложные концепции, и другим цветом, понятиями, которые вы легко запоминаете и понимаете.

Используйте систему, которая работает для вас. Не копируйте записи друга и не надейтесь, что это поможет вам в учебе.
Не переусердствуйте. Использование слишком большого количества разных цветов превратит ваши заметки в радугу, но от этого будет меньше пользы.

Шаг 4. Задавайте вопросы

Пока вы читаете учебник, записывайте вопросы по утверждениям или концепциям, которые сбивают с толку. Задавайте вопросы и во время лекции. Не бойтесь поднять руку. Если у вас есть вопрос, скорее всего, его задают и другие участники класса.

Попросите своего учителя задать вопросы, на которые, возможно, не было ответа во время урока

Шаг 5. Сделайте карточки

Есть много словарных слов, связанных с биохимией, которых вы, возможно, не видели раньше, и многие слова похожи. Изучение этих слов и различий между ними вначале поможет вам позже понять концепции, основанные на этом словаре.

Напишите бумажные карточки или сделайте цифровые карточки, которые можно носить с собой в телефоне.
Всякий раз, когда у вас будет свободное время, вытащите свои карточки и пролистайте их.