Ученые из Великобритании создали модель машинного обучения, которая предсказывает вероятность заражения человека зоонозным вирусом. Успех исследователей может повлиять на решения о приоритетах наблюдения на самой ранней стадии обнаружения практически без дополнительных финансовых или временных затрат.
По данным Программы ООН по окружающей среде (ЮНЕП), около 60 процентов. известны и 75 процентов новых или появляющихся вирусов могут передаваться от животных к человеку. Изменение климата, торговля, миграция и экспансия человека в новые географические районы, где люди вступают в тесный контакт с дикими и домашними животными, - все это способствовало увеличению распространенности зоонозных заболеваний.
Глобальное сотрудничество экспертов со всего мира необходимо для предотвращения, выявления, расследования и реагирования на различные зоонозные заболевания. Британские ученые разработали новый подход - они создали своеобразный искусственный интеллект для выявления потенциальных или незадокументированных зоонозных заболеваний.
Для этого были собраны последовательности геномов 861 вида РНК- и ДНК-вирусов из 36 семейств вирусов, способных инфицировать животных. Используя три опубликованных набора данных, каждый вирус был классифицирован в соответствии с его способностью вызывать инфекцию у людей.
Также была определена вероятность того, что вирус может вызвать заражение человека, что использовалось для построения моделей машинного обучения для прогнозирования вероятности такого заражения.
Исследователи протестировали разные модели и нашли лучшую из них, которая ранжировала 758 видов вирусов. Модель машинного обучения правильно определила 70,8 процента. вирусы с высоким или очень высоким зоонозным потенциалом
Авторы исследования подчеркивают, что их метод может обеспечить недорогой подход к доказательному эпиднадзору за вирусами. «Хотя наш анализ не был предназначен для окончательного определения биологических механизмов, лежащих в основе геномных предикторов инфекции у людей, мы смогли изучить новые закономерности, связанные с тем, как специфические особенности состава генома и группы признаков связаны с инфекционностью человека», - объясняют они.