Мы разработали тест для выявления пациентов с риском тяжелого течения COVID-19. Мы подтвердили это клинически и в лаборатории. Тест ждет коммерциализации, - сказала доктор Паула Добош из больницы Министерства внутренних дел и администрации в Варшаве в интервью Польскому агентству печати.
Szpital MSWiA принадлежит к двум крупнейшим в мире консорциумам, занимающимся исследованиями COVID-19 - Host Genomic Initiative (HGI) и The COVID Human Genetic Effort (HGE).- В период с марта по июль мы описали в нескольких научных статьях в журналах Nature, Science, Nature Immunology и Cell совместные открытия консорциумов относительно генетических вариантов, влияющих на тяжелое течение болезни COVID-19. Мы никогда не напишем, что «мы что-то обнаружили». Мы пишем все вместе как члены консорциума, потому что в этом сила этого проекта - у нас есть открытый доступ к исследованиям ученых со всего мира, и мы можем использовать все результаты», - сказала д-р Паула Добош, руководитель отдела генетики. и геномики, Центральная клиническая больница Министерства внутренних дел и администрации в Варшаве.
Исследователь ранее отвечал за научные проекты в рамках MNM Diagnostics из Познани, которая также является членом вышеупомянутых консорциумов.
В марте 2021 года доктор Збигнев Круль, участвующий в проекте госпиталя Министерства внутренних дел и администрации, сообщил в интервью PAP, что ученым удалось выявить около шести генетических аномалий, т.е. вариантов генов, которые могут влиять на более тяжелое течение COVID-19.
- Важное обстоятельство - эти исследования планировались в то время, когда еще не было вакцин. Это было самое начало пандемии. С самого начала мы думали о создании диагностического теста, который можно было бы использовать в отделении неотложной помощи. Такой тест дал бы дополнительную подсказку врачу, кого лечить в первую очередь, а кого благополучно отправить домой, - напомнила доктор Паула Добош.
Наконец, группа ученых из ЦКБ МВД и MNM Diagnositic изучила полные геномы 1235 пациентов.
- Оказалось, что в польской популяции играют роль особенно два генетических варианта. На основе этих двух вариантов был разработан тест, который мы клинически и лабораторно утвердили. В отчете мы описали все как консорциум и представили его поздней осенью 2021 года Министерству здравоохранения, Агентству медицинских исследований и Национальному центру исследований и разработок - то есть учреждениям, которые софинансировали наши исследования, - сказал доктор Добош. Она добавила: - Мы отвечали за научную сторону и на этом наша роль закончилась. Тест ожидает коммерциализации.
Как напоминает Польское агентство печати, в марте 2020 года тысячи ученых со всего мира начали совместные исследования, чтобы ответить на вопрос, какие генетические факторы могут влиять на то, что у некоторых пациентов, страдающих COVID-19, развиваются тяжелые, пожизненно угрожающее заболевание, требующее госпитализации, в то время как другие испытывают только легкие симптомы или вообще не имеют симптомов.
Подробный обзор исследований на сегодняшний день был опубликован в июле 2021 года в журнале Nature. Публикация стала работой более 3500 соавторов из более чем 1200 научных и клинических подразделений со всего мира. Результаты были получены в результате одного из крупнейших исследований ассоциаций всего генома, когда-либо проводившихся в истории. Включает почти 50 000 пациентов с COVID-19 и два миллиона неинфицированных контрольных групп.
Ученые выявили тринадцать так называемых «локусов» - областей в геноме, сильно связанных с инфекцией и тяжелым течением COVID-19. Исследователи сообщили, что два из них чаще встречаются у пациентов восточноазиатского или южноазиатского происхождения, чем у европейцев.
Особое внимание было уделено одному из двух локусов, расположенному рядом с геном FOXP4, который связан с раком легкого. Вариант FOXP4, связанный с тяжелой формой COVID-19, увеличивает экспрессию генов, что позволяет предположить, что ингибирование генов может быть потенциальной терапевтической стратегией. Другие локусы, связанные с тяжестью COVID-19, включали DPP9, ген, также участвующий в развитии рака легких и легочного фиброза, и TYK2, который участвует в некоторых аутоиммунных заболеваниях.
В интервью PAP д-р Добош сообщил, что в ближайшее время консорциум опубликует обновление статьи в «Nature».
- Появятся новые генетические варианты, и те, о которых мы говорили до сих пор, будут проверены. Ранее мы говорили о тринадцати участках генома, сильно связанных с инфекцией и тяжелым течением COVID-19. Теперь будет проверка, что может означать сужение - то есть этих областей может быть меньше. В проверке помогает чистая статистика, ведь протестированы уже десятки тысяч людей по всему миру - здесь речь идет еще о целых геномах, а не только о генах, на долю которых приходится всего 1 процент. - объявил доктор Добош.
Консорциум Host Genomic Initiative также включает команду проф. Марцин Монюшко из Белостокского университета. На прошлой неделе ученые из этой группы сообщили, что в сотрудничестве с другими центрами они идентифицировали ген, ответственный за риск тяжелого течения COVID-19. Минздрав анонсировал исследование - к концу первого полугодия этого года. - генетический тест, позволяющий быстро определить, относится ли пациент к группе повышенного риска.
Польское агентство печати запросило у Министерства здравоохранения, Агентства медицинских исследований и Национального центра исследований и разработок количество доступных в настоящее время тестов для выявления тяжелого течения COVID-19, о которых эти учреждения знают и планирую коммерциализировать.
Как пишет PAP, Министерство здравоохранения подтверждает, что ему известно о тесте, подготовленном Центральной клинической больницей Министерства внутренних дел и администрации в Варшаве, и тесте, основанном на выводах команды из Белостока. На основе исследований команды из Белостока будет разработан генетический тест для оценки риска тяжелого течения COVID-19 у пациентов в Польше, о чем на прошлой неделе заявил министр здравоохранения Адам Недзельски. По словам министра, тест должен быть готов и доступен к концу первого полугодия 2022 года.
Министерство здравоохранения сообщило PAP, что «оно активно ищет инновационные методы диагностики и решения для повышения эффективности действий против пандемии COVID-19. С этой целью оно управляет, среди прочего, Группой инноваций и Центр инноваций в области здравоохранения в Варшаве, задачей которого является мониторинг и получение инновационных решений в этой области. Вопрос диагностических тестов, разработанных как Центральной клинической больницей Министерства внутренних дел и администрации, так и городом Белосток, был предмет работы обеих указанных команд, чьи рекомендации были представлены для дальнейшего анализа."
MZ также знает о диагностическом тесте, основанном на анализе полиморфизмов, расположенных в определенных генах. Однако его эффективность и безопасность еще не проверены.
В свою очередь Агентство медицинских исследований (ABM) сообщает, что ему известно о двух тестах. Она также указала на различия в используемых в них методах.
„Генетический тест, разработанный командой проф. Тест Монюшко основан на методе ОТ-ПЦР и используется для выявления определенного варианта в генетическом материале пациента - уровень сложности теста аналогичен тесту на вирус SARS-CoV-2. Возникновение данного варианта у конкретного человека будет использовано в разработанном в рамках проекта алгоритме, сочетающем, помимо генетического фактора, возраст, пол и ИМТ пациента для оценки суммарного, относительного риска тяжести заболевания. течение COVID-19, - написал АБМ.
В тесте, подготовленном ЦСК МСВИА, было написано: «Проект, реализованный ЦСК МСВИА, заключался в проведении генетических анализов и подборе маркеров, связанных с более тяжелым течением COVID-19. В результате работы были разработаны предположения для диагностического теста на основе диагностической методики - ПЦР-ПДРФ. В настоящее время ведутся работы по использованию информации, полученной в результате геномных исследований».
Четыре проекта, связанные с прогнозированием течения COVID-19, также финансируются Национальным центром исследований и разработок (NCBiR). Это агентство сообщило PAP, что их общая сумма финансирования превышает 16,5 млн злотых.
„Из четырех проектов наиболее близким тематически к работам команды из Белостока является проект Центральной клинической больницы Министерства внутренних дел и администрации, хотя подробное сравнение на основе сообщений прессы невозможно. Исчерпывающая информация о результатах работы команды из Варшавы не является общедоступной, заявил представитель NCBiR Якуб Лацкожински. В то же время он подтвердил, что ЦСК МВД представил окончательный отчет осенью 2021 года - и таким образом проект был завершен и закрыт.